Os primeiros e únicos alunos de Hatake Kakashi foram os genins que passaram por seu exame de aprovação para formar o Time Sete – Haruno Sakura, Uzumaki Naruto e Uchiha Sasuke. Como jounin-sensei do trio, Kakashi ensinou técnicas básicas – mas não menos importantes – como Kawarimi no Jutsu, noções de taijutsu, genjutsu e ninjutsu, controle de chakra (por meio do exercício de subir em árvores apenas com os pés). No entanto, sua contribuição mais importante para o time foi certamente o trabalho em equipe e a idéia de que os companheiros são mais importantes do que qualquer missão.
  Seu tempo como professor do Time Sete, no entanto, durou muito pouco. Alguns meses após receber o time, o jounin indicou seu trio de alunos para o Chuunin Shiken. Depois que os três passaram pelas duas primeiras fases e os garotos obtiveram vagas nas finais, Kakashi focou toda a sua atenção em Sasuke, no período entre as preliminares e as finais das lutas do torneio. Durante as semanas que antecederam as batalhas finais, ensinou a Sasuke uma de suas únicas técnicas originais, o Raikiri (também chamado de Chidori, que é o nome adotado pelo Uchiha ao usar a técnica), especificando a quantidade de vezes que o jutsu poderia ser usado antes de o Selo Amaldiçoado começar a agir.
  Com o Chuunin Shiken, o Time Sete se despedaçou, e cada um de seus pupilos passou a treinar com um dos Sannins de Konoha (Naruto seguiu Jiraya, Sakura ficou com Tsunade, e Sasuke fugiu para ser treinado por Orochimaru). Depois dos três anos que separam Naruto de Naruto Shippuuden, Kakashi voltou a testar seus alunos restantes – Naruto e Sakura – numa nova versão do teste do sino.